Гвидо Манкузи родился в Портичи (Италия) в 1966 году. Переехав в Вену, учился игре на фортепиано под руководством отца, позднее гастролировал во многих странах мира как солист знаменитого Венского хора мальчиков.
Учился в Венской школе музыки и Венской консерватории (классы фагота и вокала). Затем продолжил обучение в Венском университете музыки и исполнительского искусства в классе композиции Эриха Урбаннера и классе дирижирования Карла Остеррайхера. В 1992 году защитил диссертацию по творчеству Пауля Хиндемита.
В 1985 году Г. Манкузи основал Барочный ансамбль «Виндобона», с которым на протяжении последующих 10 лет выступал с концертами, посвященными барочной и классической музыке. С 1997 года является главным дирижером оркестра Шенбруннского дворца в Вене.
Манкузи также занимал пост постоянного приглашенного дирижера Словакского филармонического оркестра, Концертного оркестра Будапешта, Венского салон-оркестра и Симфонического оркестра Кастилии и Леона. С 2000 по 2002 год работал в качестве ассистента Карлоса Кальмара в Венском Тонкюнстлер-оркестре. В Англии выступал с Лондонским консортом старинной музыки, в Японии – с Камерным оркестром Нариты и Симфоническим оркестром Такасаки, в США – с коллективом New York Baroque Players.
Г. Манкузи много работает в опере. Являлся музыкальным директором оперных театров Граца и Санкт-Пёльтена (Австрия), Киля и Кобурга (Германия), компании «Объединенные театры Вены», художественным руководителем оперного фестиваля в Клостернойбурге (1997-2000). Был ассистентом Риккардо Мути в театре «Ла Скала» и Адама Фишера на оперном фестивале в Байрёйте, дирижировал премьерами в Венской камерной опере, Театре Schauspielhaus в Вене, Государственном театре Клагенфурта (Австрия), Оперном театре Эрфурта (Германия), Новой Израильской опере в Тель-Авиве.
В 2002 году Гвидо Манкузи был назначен главным дирижером Государственного театра Клагенфурта. Премьеры под его руководством в текущем сезоне включают оперы «Так поступают все» Моцарта и «Пиковая дама» Чайковского. С 2008 года также тесно сотрудничает с Венским оперным театром Volksoper.
Как приглашенный дирижер выступал на Венских фестивалях Wiener Festwochen и Klangbogen.
