Ян Мареш родился в Монако. Обучался игре на фортепиано и ударных в Музыкальной академии Монте-Карло, затем увлекся джазом. С 1983 года учился у знаменитого джазового гитариста Джона Маклафлина, в 1989 году стал его аранжировщиком. В 1984–1986 гг. изучал теорию джаза в Музыкальном колледже Беркли (Бостон). В 1986 году получил грант Фонда принцессы Грейс и поступил в Джульярдскую школу (Нью-Йорк), где в 1992 году закончил класс композиции у Дэвида Даймонда. В 1993 году переехал в Париж, где продолжил обучение в Институте исследования и координации акустики и музыки (IRCAM) у Тристана Мюрая.
В 1991 году Ян Мареш получил II премию на Конкурсе композиторов в Триесте и один из первых заказов (пьеса Parmi les étoiles fixes для Оркестра де Пари). В 1994 году Французская академия изящных искусств наградила его призом Россини, тогда же он стал финалистом конкурса композиторов Gaudeamus и Композиторской премии Фонда принца Пьера. Позже дважды получал премии Sacem – французского Общества музыкальных авторов, композиторов и издателей.
Сочинения Яна Мареша создавались по заказу Филармонического оркестра Радио Франс, «Лондонской симфониетты», «Перкуссионистов Страсбурга», Ensemble intercontemporain, IRCAM, хора Accentus, фестиваля в Экс-ан-Провансе и многих других коллективов и культурных институций. Среди исполнителей его произведений – дирижеры Пьер Булез, Лейф Сегерстам, Леонард Слаткин, Семён Бычков, Лоранс Экильбе, Матиас Пинчер, Паскаль Рофе, Петер Рундель, Сусанна Мялкки, Тито Чеккерини, Жан Деруайе, Илан Волков, Симфонический оркестр Би-Би-Си, национальные оркестры Лиона и Капитолия Тулузы, оркестр «Столетия», филармонические оркестры Хельсинки, Монте-Карло, оркестры Юго-Западного радио Германии и цюрихского Тонхалле, ансамбли 2E2M, Alter Ego, Alternance, Ars Nova, Avanti!, Ictus, Klangforum Wien, musikFabrik, Sinfonia 21 и многие другие.
Ян Мареш регулярно дает мастер-классы, в том числе в IRCAM, где в 2006–2011 гг. был профессором композиции и компьютерной музыки. В 2007–2012 гг. преподавал оркестровку в Парижской национальной консерватории музыки и танца, в настоящее время преподает там же электроакустическую композицию. Продолжая сотрудничество с Джоном Маклафлином, выступил аранжировщиком и бас-гитаристом на его альбомах Time Remembered (1993), The Promise (1995), Thieves & Poets (2003, с участием скрипачки Виктории Мулловой и виолончелиста Мэтта Хаймовица).
