Один из ведущих дирижеров Великобритании молодого поколения, Джонатан Брэтт начал свое музыкальное образование в Королевском колледже музыки в Лондоне, где обучался по классам тромбона, альта и фортепиано. Позже он учился в Guildhall School of Music and Drama и Лондонском университете, стажировался как оркестровый дирижер у Диего Массона в Сёррее и как дирижер хора у Джона Пула в Лондоне, а также как помощник дирижера в Королевском Северном колледже музыки в Манчестере. Принимал участие в мастер-классах двух выдающихся российских дирижеров – Ильи Мусина и Юрия Симонова.
Первые профессиональные успехи Джонатана Брэтта относятся к периоду работы с Камерным оркестром Сёррея. В 1990 году молодой дирижер возглавил основанный в том же году коллектив English Classical Players, который на сегодняшний день признается одним из лучших оркестров Великобритании. Первоначально задуманный как камерный коллектив, в течение последних 10 лет оркестр существенно расширил репертуар и сегодня выступает в различных составах – от ансамбля до большого симфонического оркестра. С English Classical Players Джонатан Брэтт выступал на ведущих концертных площадках не только Лондона, но и всей Великобритании, записывался на радио ВВС 3 и Classic FM, получив многочисленные положительные отклики музыкальных критиков. Кроме того, коллектив постоянно получает предложения выступать за рубежом.
Параллельно с работой с оркестром English Classical Players Джонатан Брэтт сотрудничает с другими симфоническими и хоровыми коллективами Великобритании и Европы. В 1986-1992 годах он являлся художественным руководителем Сёррейского камерного оркестра, в 1996-1999 – молодежного оркестра Траффордской филармонии, в 1994-2002 – камерного оркестра Сейла (Австралия). Джонатан Брэтт выступал с Королевскими филармоническими оркестрами Лондона и Ливерпуля, Северным симфоническим оркестром, коллективом Королевского Хорового общества, BBC Singers и другими. В последние годы дирижер много работал в Австрии, Бельгии, Франции, Италии, Польше, Румынии, Испании, Венгрии, на Кипре.
Джонатан Брэтт стал первым дирижером Великобритании, который был приглашен работать с оркестром Московской филармонии. С ним он успешно дебютировал в Концертном зале им. П.И.Чайковского в декабре 2002 года, исполнив Девятую симфонию Бетховена. Впоследствии Джонатан Брэтт неоднократно сотрудничал с российским коллективом в качестве приглашенного дирижера, выступая в ним в Концертном зале им. П.И.Чайковского и в Большом зале консерватории в Москве, а также гастролируя за рубежом.