Даниил Харитонов родился в 1998 году в Южно-Сахалинске. Окончил Центральную музыкальную школу при Московской государственной консерватории имени П. И. Чайковского (класс Валерия Пясецкого) и Королевский колледж музыки в Лондоне (класс профессора Дмитрия Алексеева).
Победитель многих конкурсов, в числе которых «Моцарт-вундеркинд» в Вене (2006), «Новые имена» (2008), «Щелкунчик» (2010), Владимира Крайнева в Москве (2015). В 2015 году, в возрасте 16 лет, завоевал III премию и бронзовую медаль XV Международного конкурса имени П. И. Чайковского.
Выступал в сопровождении Госоркестра России имени Е. Ф. Светланова, Большого симфонического оркестра имени П. И. Чайковского, Национального филармонического оркестра России, Московского камерного оркестра Musica Viva, Государственного камерного оркестра «Виртуозы Москвы», Академического симфонического оркестра Московской филармонии, симфонических оркестров корпорации NHK и газеты Ёмиури (Япония), телерадиокомпании KBS (Южная Корея), Китайского филармонического и симфонических оркестров Пекина, Гуанчжоу и Сучжоу, филармонических оркестров Халиско и Мехико, Национального симфонического оркестра радио Ирландии (RTÉ), филармонических оркестров Кейптауна, Йоханнесбурга и Дурбана, симфонического оркестра Театра Сан-Паулу, Будапештского фестивального оркестра под управлением Ивана Фишера, Лондонского камерного оркестра и Королевского филармонического оркестра под управлением Владимира Ашкенази.
Гастролировал более чем в 50 странах мира. Концерты пианиста проходили во всех главных залах Москвы, Санкт-Петербурга и во многих городах России.
Неоднократно принимал участие в Международном фестивале «Музыкальный Олимп» в Санкт-Петербурге (2012, 2015, 2021), выступал в Карнеги-холле (Нью-Йорк), Тонхалле (Цюрих) и Санкт-Морице.
Даниил Харитонов часто выступает в странах Азии на крупнейших концертных площадках, среди которых концертный зал Токио Опера Сити, Токийский столичный центр искусств (Tokyo Metropolitan Theatre) и Сантори-холл, зал корпорации NHK в Осаке, Минато-Мирай-холл в Иокогаме, Сеульский центр искусств. Его концерты транслировали телеканалы KBS и NHK. В 2023 году артист провел турне с Заслуженным коллективом России Академическим симфоническим оркестром Санкт-Петербургской филармонии под руководством Николая Алексеева по крупнейшим городам Китая.
Член жюри XXV Международного телевизионного конкурса юных музыкантов «Щелкунчик» (2024). Амбассадор федерального проекта «Русская фортепианная школа».