Екатерина Годованец родилась в Москве. Окончила Академическое музыкальное училище при Московской государственной консерватории имени П. И. Чайковского, Парижскую консерваторию и аспирантуру парижской Высшей школы музыки имени Альфреда Корто (класс профессора Каролин Дюма). Участвовала в мастер-классах Кристы Людвиг, Поль-Эмиля Дебера, Александрины Милчевой, Жан-Филиппа Лафона, Франсуа Лёру, Дитриха Хеншеля, Йорга Демуса. Продолжает совершенствоваться под руководством Катарины Лигендцы.
Лауреат международных конкурсов исполнителей французской вокальной музыки в Тулузе (Франция, 2005, Гран-при), имени Вильгельма Стенхаммара в Норрчёпинге (Швеция, 2006, І премия и приз зрительских симпатий) и оперных певцов в Тулузе (Франция, 2006, ІІІ премия), дипломант Международного конкурса королевы Сони в Осло (Норвегия, 2005).
С 2012 года – солистка Нюрнбергской государственной оперы (Германия), где в ее репертуар вошли партии Леоноры, Амелии и Дездемоны («Трубадур», «Бал-маскарад» и «Отелло» Верди), Сенты и Зиглинды («Летучий голландец» и «Валькирия» Вагнера), Мадлен («Андре Шенье» Джордано), Русалки («Русалка» Дворжака), Маршальши и Арабеллы («Кавалер розы» и «Арабелла» Р. Штрауса), Гертруды («Гензель и Гретель» Хумпердинка), Роксаны («Король Рогер» Шимановского). Сотрудничала с Национальным театром Сан-Карлуш в Лиссабоне (партии Фьордилиджи в опере «Так поступают все женщины» Моцарта и Зигруны в «Валькирии» Вагнера, режиссер Грэм Вик), Большим театром России (партии Маршальши в «Кавалере розы» Р. Штрауса и Лизы в «Пиковой даме» Чайковского), Оперным театром Эрфурта («Трубадур»), Оперой Масси, Фламандской оперой и Каирской оперой. В июне 2009 года выступила в партии Татьяны в опере «Евгений Онегин» на сцене Зала Чайковского в концерте, посвященном 210-летию со дня рождения А. С. Пушкина (Госоркестр России имени Е. Ф. Светланова, дирижер – Марк Горенштейн). Запись концерта была выпущена фирмой Dabringhaus & Grimm (Германия).
Ведет активную концертную деятельность. Выступала с Симфоническим оркестром Большого театра, Российским национальным оркестром, Ярославским академическим губернаторским симфоническим оркестром, Томским академическим симфоническим оркестром, Симфоническим оркестром Крымской государственной филармонии под управлением известных дирижеров, среди которых Михаил Плетнёв, Василий Синайский, Михаил Юровский, Александр Рудин, Александр Соловьёв, Алексей Гуляницкий, Александр Чернушенко, Александр Слуцкий, Марко Летония, Донато Ренцетти, Гвидо Йоханнес Румштадт и Жан Деруайе. Участвовала в исполнении Второй симфонии, «Песен странствующего подмастерья» и «Песен об умерших детях» Малера, циклов «Пять песен на стихи Матильды Везендонк» Вагнера, «Четыре последние песни» Р. Штрауса, «Поэма любви и моря» Шоссона, реквиемов Шумана, Верди, Дворжака, Дюрюфле, Реквиема памяти жертв фашизма Фернанду Лопеш-Грасы, Stabat Mater Россини, кантаты «Александр Невский» Прокофьева. Принимала участие в фестивалях в России, Франции, Швейцарии, Германии и Италии. Записывалась на Радио Франс.