Екатерина Корнишина родилась в 1995 году в Москве. С четырех лет выступала в составе детского хора на сцене Большого театра России. В 2003 году поступила в Центральную музыкальную школу при Московской консерватории (класс профессора Юрия Должикова). В 13 лет стала победителем конкурса «Новые имена» и в качестве лауреата принимала участие в фестивалях Crescendo и «Звезды на Байкале» Дениса Мацуева.
По окончании ЦМШ по приглашению Владимира Спивакова стала солисткой Национального филармонического оркестра России и обладательницей нового инструмента, подаренного маэстро; в дальнейшем неоднократно выступала в составе Государственного камерного оркестра «Виртуозы Москвы» под управлением Владимира Спивакова.
В 2018 году окончила Московскую государственную консерваторию имени П. И. Чайковского (класс профессора Александра Голышева) и продолжила обучение в Академии музыки королевы Софии в Мадриде (класс профессора Жака Зуна).
Принимала участие в мастер-классах знаменитых европейских профессоров, таких как Феликс Ренггли, Франсуа Лоран, Висенс Прат, Венсан Люка, Шигенори Кудо, Давиде Формизано, Керстен Макколл, Филипп Бернольд, Софи Шерье, Андреа Либеркнехт.
Выступала на одной сцене с Денисом Мацуевым, Владимиром Федосеевым, Владимиром Спиваковым, Александром Сладковским, Кристианом Ярви. Участница международных музыкальных фестивалей во Франции, Норвегии, Германии, Израиле, России, Греции, Австрии и Италии.
В 2020 году фирма «Мелодия» выпустила дебютный альбом флейтистки, в который вошли пьесы Рахманинова в аранжировках Корнишиной для флейты и фортепиано, записанных с пианистом Рустамом Ханмурзиным.