Елена Цыбко окончила Московскую государственную консерваторию имени П. И. Чайковского по специальностям «музыковедение» (класс доцента Татьяны Кюрегян) и «орган» (класс профессора Алексея Паршина).
Лауреат III Европейского конкурса музыкантов-исполнителей имени Рокко Родио (I премия; Италия, 2004) и I Международного конкурса органистов Валерия Кикты (II премия; Москва, 2005). Удостоена специальной премии на XII Международном конкурсе имени И. С. Баха в Лейпциге (2000). Обладатель диплома «За высокое исполнительское мастерство» на I фестивале органной и камерной музыки «Северный Орфей» в Кирове (2001).
Выступала с Симфоническим оркестром Москвы «Русская филармония» (дирижеры – Саулюс Сондецкис, Владимир Понькин, Юрий Кочнев), Московским камерным оркестром Центра Павла Слободкина, Камерным оркестром Московской консерватории, оркестром «Московская камерата» (дирижер – Игорь Фролов), ансамблем «Академия старинной музыки» под управлением Татьяны Гринденко, ансамблем солистов оркестра Большого театра (дирижер – Леонид Николаев).
Сотрудничала с хоровыми коллективами: Московским хоровым ансамблем духовной музыки «Благовест» под управлением Галины Кольцовой, Молодежным хором Ганновера (дирижер – Клаус-Юрген Этцольд), Хором студентов Московской консерватории (дирижер – Станислав Калинин), Свято-Никольским хором Государственной Третьяковской галереи (дирижер – Алексей Пузаков).
В разные годы преподавала на кафедре органа и клавесина Московской консерватории и в Центральной музыкальной школе при МГК. В настоящее время – педагог органной кафедры Государственного музыкально-педагогического института имени М. М. Ипполитова-Иванова. Член жюри российских и зарубежных конкурсов органистов.
В дискографии органистки – сольные альбомы The Hugo Mayerinthe Alexander Church, KirovCity (2001), Live Bach (2004), «И. С. Бах. От Адвента до Троицы». Диск 1: «Рождество» (2011), а также запись кантаты Stabat Mater Перголези (с Андреем Немзером и Светланой Полянской) и диски из серии «Органные произведения. Алексей Паршин и его ученики играют на органах Московской консерватории», где представлена музыка Гедике, Шостаковича, Кикты и Волкова.