Елизавета Бородаева родилась в 1995 году в Пермском крае. Начала обучаться игре на органе в Пермском музыкальном колледже у Евгении Камянской. Окончила Санкт-Петербургскую государственную консерваторию имени Н. А. Римского-Корсакова (класс органа доцента Юлии Глазковой /Юферевой/, класс клавесина профессора Ивана Розанова). В 2022 году завершила обучение в ассистентуре-стажировке под руководством профессора Даниэля Зарецкого. Совершенствовалась в органных академиях в Котке (Финляндия), Бозау и Любеке (Германия), Алкмааре (Нидерланды) и Калининграде.
Принимала участие в мастер-классах известных европейских органистов, среди которых Ханс Фагиус, Лоренцо Гиельми, Вольфганг Церер, Питер ван Дейк, Мартин Зандер, Давид Кассан, Олли Портан, Сергей Черепанов, Арвид Гаст, Франц Данкзагмюллер, Мартин Шмединг, Йоанн Вексо.
Выступает с сольными и ансамблевыми программами в городах России и за рубежом. Сотрудничала с Архангельским филармоническим камерным оркестром под управлением Владимира Онуфриева.
Лауреат всероссийских и международных конкурсов в Перми, Калининграде, Москве, Санкт-Петербурге, Кондопоге, Германии, Польше, Казахстане. Награждена президентской премией по поддержке талантливой молодежи (2014). Обладательница Гранта Президента Российской Федерации (2015–2020). Удостоена всероссийской премии «Органист года» в номинации «Дебют» (2021).