Маргарита Молчанова родилась в 2000 году в Москве. В 2007 году поступила в Центральную музыкальную школу при Московской государственной консерватории имени П. И. Чайковского в класс Н. В. Богдановой.
Маргарита — лауреат международных конкурсов и фестивалей: имени Б. Дварионаса в Вильнюсе (Литва, 2008), «Музыка без границ» в Друскининкае (Литва, 2009, Первая премия в категории «солист», Гран-при в категории «концерт с камерным оркестром»), имени А. Н. Скрябина в Париже (2010, Первая премия), молодых музыкантов в Москве (2013, Третья премия), имени К. Н. Игумнова в Липецке (2013, Первая премия), Ю. Маргулиса в Фрайбурге (Германия, 2014, 2015), Всероссийского детско-юношеского фестиваля камерных ансамблей в Москве (2013, Гран-при) и Общероссийского конкурса «Молодые дарования России» от Министерства культуры РФ (2013). Дипломантка конкурса имени В. Крайнева в Харькове (Украина, 2012) и телевизионного конкурса «Щелкунчик» (2013), обладательница
Специальной премии жюри Международного конкурса-фестиваля в Фольс-ам-Шлерн (Италия, 2013).
Маргарита Молчанова принимала участие в мастер-классах и концертах в рамках музыкальных фестивалей, проходивших в США, Великобритании, Франции, Германии, Италии и Литве.
Участница проектов благотворительных фондов В. Спивакова и «Новые имена», неоднократно выступала на отчетных концертах ЦМШ, играла в Малом и Рахманиновском залах Московской консерватории, залах Московского международного Дома музыки, Центра Павла Слободкина, галереи А. Шилова, музеев М. Ермоловой, М. Цветаевой, Международного центра Рерихов и других.
Маргарита выступала с Московским камерным оркестром Центра Павла Слободкина (дирижер И. Гайсин), Московским камерным оркестром Cantus Firmus (дирижер А. Хургин), Литовским национальным симфоническим оркестром (дирижер Р. Шервеникас), Харьковским молодежным академическим симфоническим оркестром «Слобожанский» (дирижер Ш. Палтаджян). На протяжении многих лет принимает участие в фестивале Фонда В. Спивакова «Москва встречает друзей».