Маргот Ойцингер родилась в Граце (Австрия), получила образование в университете родного города. С самого начала обучения она специализировалась на старинной музыке, совершенствовала свое мастерство, посещая мастер-классы Эммы Кёркби, Петера Коя и Джилл Фельдман. Лауреат Баховского международного конкурса в Лейпциге (2008) и Международного конкурса вокального барокко в Шиме (Бельгия, 2006).
Маргот Ойцингер выступает с концертными программами и поет в операх XVII–XVIII веков. Важное место в ее творчестве занимают хоровые (ансамблевые) произведения раннего барокко и оратории. Среди сценических партнеров певицы – ансамбль Collegium Vocale Gent под управлением Филиппа Херревеге, Оркестр церкви Предигеркирхе в Базеле под управлением Йорга-Андреаса Бёттихера, вокальный ансамбль Sette Voci под управлением Петера Коя и другие коллективы.
Артистка выступала на таких известных сценах, как Консертгебау в Амстердаме, Музикферайн в Вене, Дворец каталонской музыки в Барселоне, Сантори-холл в Токио, Арсенал в Меце, Театр принца-регента в Мюнхене, Церковь Св. Фомы (Томаскирхе) в Лейпциге, Церковь Св. Роха (Сен-Рок) в Париже, Музыкальный центр в Утрехте, Церковь Богородицы (Фрауэнкирхе) в Дрездене, Альте Опер во Франкфурте.
Сотрудничала с выдающимися дирижерами, в числе которых Филипп Херревеге, Жорди Саваль, Масааки Судзуки, Джон Батт, Андреа Маркон, Михи Гайгг, Лоренцо Гиельми, Кристоф Прегардьен, Конрад Юнгхенель и Рудольф Лутц. В частности с Рудольфом Лутцем Маргот Ойцингер приняла участие в записи на DVD полного собрания произведений И. С. Баха при поддержке Фонда Баха в Санкт-Галлене (Швейцария).
В дискографии певицы – записи ораторий, кантат, опер и других произведений, выпущенные фирмами Harmonia mundi, φ («Фи»), CPO, Challenge Records и другими. В 2019 году вышел ее CD-сборник концертных арий Мендельсона под управлением Михи Гайгг. Среди недавних ангажементов певицы – «Возвращение Улисса на родину» Монтеверди (Пенелопа) в Театре Массимо в Палермо, в числе выступлений сезона 2021/22 – исполнение Мессы си минор И. С. Баха в Москве, Санкт-Петербурге и Амстердаме.
