Мария Белугина родилась во Владимире, где получила начальное музыкальное образование. Окончила Государственный музыкальный колледж имени Гнесиных и Московскую государственную консерваторию имени П. И. Чайковского (класс профессора Алексея Кошванца). В составе камерных ансамблей гастролировала в городах России, Бельгии, Испании, Италии и Швеции.
С 2006 года занимается педагогической деятельностью. В 2011–2018 гг. преподавала в Музыкальном училище имени Гнесиных. Доцент Международной академии музыки Блэкмора в Берлине и Университета Калайдос в Цюрихе, преподает в Мастерской скрипичного искусства в Москве. Дает мастер-классы в городах России. Принимала участие в работе жюри юношеских конкурсов. В 2018 году входила в состав экспертной комиссии фонда «Новые имена» под руководством Дениса Мацуева.