Марк Элдер с 2000 года является художественным руководителем старейшего в Европе симфонического оркестра Халле (Hallé) — коллектива, основанного более 150 лет назад в Манчестере дирижером сэром Чарльзом Халле. Почти полтора десятилетия Марк Элдер возглавлял Английскую национальную оперу. В разные годы был главным приглашенным дирижером Бирмингемского симфонического оркестра, Симфонического оркестра Би-Би-Си и Камерного оркестра London Mozart Players, а также художественным руководителем Филармонического оркестра Рочестера (США).
Сэр Марк Элдер постоянно выступает с ведущими симфоническими оркестрами мира, среди которых оркестры Берлинской и Мюнхенской филармоний, Оркестр Парижа, Чикагский симфонический и Бостонский симфонический оркестры, Роттердамский филармонический, Национальный симфонический оркестр Вашингтона, амстердамский Консертгебау и оркестр Нидерландского радио, оркестры Бергена и Гетеборга, Цюрихский Tohnhalle и Кёльнский Gürzenich, симфонический оркестр Академии «Санта Чечилия» и Будапештский фестивальный оркестр, Австралийский молодежный оркестр и Симфонический оркестр ОАЭ. В 2008 году Марк Элдер впервые выступил с Российским национальным оркестром и в нынешнем сезоне продолжает сотрудничество с этим прославленным коллективом.
В Великобритании маэстро тесно сотрудничает с Лондонским филармоническим и Лондонским симфоническим оркестрами, Оркестром Эпохи Просвещения и оркестром Britten Sinfonia, ежегодно участвует в знаменитых Променадных концертах Би-Би-Си (фестивале BBCProms).
Деятельность в качестве оперного дирижера привела Марка Элдера на сцены престижных оперных театров мира. Это Английская национальная опера «Ковент-Гарден», Нью-Йоркская «Метрополитен-опера», Парижская национальная опера, Лирическая опера Чикаго. Маэстро принимает участие в Глайндборнском оперном фестивале и вагнеровском фестивале в Байройте, а также выступает на фестивалях в Мюнхене, Амстердаме, Цюрихе, Женеве, Берлине и Брегенце. Среди недавних постановок, осуществленных дирижером, — «Король Рогер» Шимановского, «Тангейзер» и «Парсифаль» Вагнера, «Богема» Пуччини, «Травиата» и «Фальстаф» Верди, «Воццек» Берга, «Билли Бадд» Бриттена, мюзикл «Чудесный город» Бернстайна.
Марк Элдер осуществил записи с большим количеством оркестров, в том числе с Лондонским филармоническим, Бирмингемским симфоническим, Симфоническим оркестром Би-Би-Си, оркестрами Английской национальной оперы, Рочестера и ОАЭ.
Записи оратории «Сновидение Геронтия» и Скрипичного концерта Элгара, а также оперы «Гибель богов» Вагнера были удостоены премии «Граммофон». Самая последняя работа Марка Элдера — запись оратории «Апостолы» Элгара — получила престижную премию от BBC Music Magazine и была названа «записью года» (2013).
Дирижер участвовал в записи музыки к телевизионным фильмам о жизни и творчестве Верди на телеканале Би-Би-Си (1994) и Доницетти на немецком телевидении (1996). В 2011 и 2012 годах совместно с телеканалом Би-Би-Си были выпущены серии документальных фильмов «Симфония» и «Маэстро в опере» с участием М. Элдера. Среди оперных записей маэстро, сделанных в последние годы, — «Валькирия» Вагнера и четыре оперы Доницетти («Дон Себастьян Португальский», «Имельда ди Ламбертацци», «Линда ди Шамуни» и «Мария ди Роган»), выпущенные на лейбле Opera Rara (с 2011 года дирижер является художественным директором этой звукозаписывающей компании).
Марк Элдер удостоен высоких почестей на родине. Он – Командор Ордена Британской империи (1989), лауреат престижной премии имени Лоуренса Оливье (1991), присужденной дирижеру за выдающуюся деятельность в опере «Ковент-Гарден». В 2006 году М. Элдер стал «дирижером года», а в 2011 — почетным членом Лондонского Королевского филармонического общества.