Уроженец Дрездена МихаэльГюттлер обучался в Дрезденской Высшей школе музыки имени Карла Марии фон Вебера по классам скрипки, трубы, фортепиано и хорового дирижирования. Принимал участие в мастер-классах Леонарда Бернстайна, Серджиу Челибидаке, Ильи Мусина, Валерия Гергиева и других прославленных дирижеров. Был участником Программы по поддержке молодых дирижеров Немецкого музыкального совета. Лауреат ряда международных дирижерских конкурсов в Италии, Германии и Великобритании.
В 1998–2002 гг. работал в Опере Клагенфурта (Австрия), став самым молодым штатным дирижером за всю историю этого театра. Сотрудничал с Екатеринбургским театром оперы и балета, за постановку «Летучего голландца» Вагнера был номинирован на премию «Золотая маска».
В 2013–2017 гг. возглавлял Финскую национальную оперу, где в его репертуар входили оперы «Аида» и «Дон Карлос» Верди, «Богема» и «Турандот» Пуччини, «Кавалер розы» Р. Штрауса, «Нос» Шостаковича, «Нюрнбергские майстерзингеры» Вагнера и «Борис Годунов» Мусоргского. В эти же годы был приглашенным дирижером Мариинского театра, где под его управлением шли «Тристан и Изольда», «Парсифаль», «Лоэнгрин», «Летучий голландец» Вагнера, «Фальстаф», «Дон Карлос», «Аида», «Травиата» Верди, «Свадьба Фигаро» Моцарта, «Лючия ди Ламмермур» Доницетти, «Ариадна на Наксосе», «Женщина без тени» Р. Штрауса и многие другие. Весной 2018 года маэстро провел всю тетралогию Вагнера «Кольцо нибелунга».
МихаэльГюттлер выступает в крупнейших театрах мира, в числе которых Парижская национальная опера, Венская государственная опера, Большой театр России, Вашингтонская национальная опера, оперные театры Венеции, Болоньи, Неаполя, Бари, Варшавы, Мадрида, Лиссабона, Лозанны, Праги, Токио, Дрездена, Франкфурта. Многолетнее сотрудничество связывает дирижера с Венской государственной оперой, где он, начиная с 2010 года, провел множество спектаклей, включая оперы «Риголетто», «Севильский цирюльник», «Золушка», «Ариадна на Наксосе», «Набукко», «Вертер», «Евгений Онегин», «Борис Годунов», «Хованщина». В 2020 году с успехом исполнил «Лоэнгрина» Вагнера.
Как симфонический дирижер Гюттлер сотрудничал с Израильским филармоническим оркестром и Оркестром де Пари, симфоническими оркестрами радио Мадрида и Турина, Шведского радио, Дрезденской государственной капеллой, Дрезденским филармоническим оркестром, Национальным филармоническим оркестром России, Академическим симфоническим оркестром Московской филармонии. В 2016 году дебютировал с новой постановкой «Нюрнбергских мейстерзингеров» Вагнера на Глайндборнском оперном фестивале. В 2023 году дебютировал в миланском театре Ла Скала с «Саломеей» Р. Штрауса.