Райнер Хонек родился в 1961 году в австрийском городе Ненцинг (земля Форарльберг). Начав учиться игре на скрипке в возрасте 7 лет, продолжил занятия в Высшей школе музыки и исполнительских искусств в Вене (у профессора Бертштингера), а также брал частные уроки у профессора Штаара.

Получив в 1977 г. первый приз на конкурсе «JeunesseMusicale» в Вене, а в 1978 — грант на обучение от Фонда Карла Бёма, учрежденного Венским филармоническим оркестром, Райнер Хонек уже в 17 лет получил возможность играть в составе Венских «филармоников».

Спустя три года, в 1981 году, Хонек вошел в группу первых скрипок Венского филармонического оркестра и оркестра Венской Штаатсоперы. В 1984 он занял место концертмейстера оперного оркестра, а в 1992 — филармонического.

Помимо работы в оркестрах, Хонек регулярно выступает в качестве солиста и камерного исполнителя как в Австрии — в частности, на фестивале в Брегенце, так и в других странах Европы (включая «Променад-концерты» в лондонском Альберт-холле, где дебютировал в 1993 г.), Японии и США (впервые выступил в Эври Фишер-холле в 1994). Наиболее яркие события  его сольной карьеры — исполнения Скрипичного концерта А. Дворжака с оркестром Венской филармонии под управлением Мариса Янсонса в 2000 г.; SinfoniaConcertante В. А. Моцарта (с альтистом Тобиасом Леа) под управлением Риккардо Мути в Вене и во время гастролей в Японии и Америке (в т. ч. в Карнеги-холле); Концерта А. Берга с Венским филармоническим оркестром (дирижер Даниэль Гатти) и оркестром Мариинского театра (дирижер Валерий Гергиев); Концерта И. Стравинского под управлением Андреса Ороско-Эстрады.

Хонек регулярно выступает с Японским симфоническим оркестром Иомиури, с которым исполнил, в частности, Скрипичный концерт Л. Бетховена, а в апреле 2010 года — все сочинения Моцарта для скрипки с оркестром в Сантори-холле (Токио).

В дискографии скрипача — сольные партии в «Шехерезаде» Н. Римского Корсакова (Венский филармонический оркестр, дирижер Сейджи Озава) на лейбле Philips (1993), «Жизни героя» Р. Штрауса (дирижер Кристиан Тилеман) на DeutscheGrammophon (2002). Он записал Концерты А. Дворжака и Ф. Мендельсона с Чешским филармоническим оркестром в Праге (на лейбле PonyCanyon), все сочинения Ф. Шуберта для скрипки и фортепиано (FrohlaStudios), двойной альбом со Скрипичными концертами №№ 3 и 5, SinfoniaConcertante (Т. Леа, альт) и Concertone для 2-х скрипок с оркестром (Милан Сетена, скрипка) Моцарта в сопровождении ансамбля Vienna Classical Players, дирижер Мартин Кершбаум (Orfeo).

Райнер Хонек известен и как камерный музыкант. Он был одним из основателей и примариусом оркестра «Венские виртуозы» (с 1989 по 1999), художественным руководителем ансамблей ViennaStringSoloists (1982 – 2004), EnsembleWien (2000 – 2011) и камерного оркестра «Вена – Берлин» (с 2009 г.), с которыми много записывался на радио, телевидении и компакт-дисках (в основном на лейбле Koch). Среди выдающихся артистов, с которыми он работает в течение многих лет, — Джесси Норман, Кэтлин Бэттл, Ангелика Кирхшлагер, Хосе Каррерас, Андре Превен, Юрий Башмет и Ефим Бронфман.

В последние годы Райнер Хонек активно расширяет сферу своей творческой деятельности, выступая в качестве дирижера, а также одновременно приглашенного концертмейстера и солиста с такими коллективами, как филармонический оркестр Нагойи, Киои-симфониетта и Симфонический оркестр Иомиури (Япония), Симфонический оркестр Мальмё (Швеция), филармонический оркестр Ниццы (Франция) и ряд других. В июне 2013 года он выступил с оркестром Мариинского театра в качестве приглашенного дирижера на фестивале «Звезды белых ночей».

Райнер Хонек играет на скрипке «ex-Hammerle» А. Страдивари (1709), предоставленном ему Австрийским национальным банком.