Самир Джафаров родился в 1976 году в Нахичеванской АССР (Азербайджан). Обучался в Азербайджанском государственном университете культуры и искусств (1993–1997, театральный факультет, степень бакалавра), в магистратуре Бакинской музыкальной академии имени Узеира Гаджибекова (1999–2001, факультет сольного пения), совершенствовал мастерство в Центре оперного пения Галины Вишневской (2002–2004).
Лауреат международных конкурсов вокалистов, в том числе конкурса имени Муслима Магомаева в Москве (2010, II премия).
Преподавал в Азербайджанской национальной консерватории. Был директором Гянджинской государственной филармонии. В настоящее время – солист Азербайджанского государственного академического театра оперы и балета.
В репертуаре – партии в операх «Кёроглы» (заглавная партия) и «Аршин мал алан» (Аскер) Гаджибекова, «Севиль» Амирова (Балаш), «Травиата» Верди (Альфред), «Тоска» Пуччини (Каварадосси), «Сельская честь» Масканьи (Туридду), «Паяцы» Леонкавалло (Канио), «Алеко» Рахманинова (Молодой цыган).
Гастролировал в России, Беларуси, Казахстане, Туркменистане, Литве, Республике Корея, Китае, Иране, Турции, Македонии, Венгрии, Италии, Испании, Франции, Австрии, Германии, Андорре, США, Уругвае.
Народный артист Азербайджана. Обладатель Премии Президента Азербайджана.