Сергей Ковнир окончил в 2006 году Национальную музыкальную академию Украины имени П. И. Чайковского (класс народной артистки СССР Е. С. Мирошниченко). С 2003 года является солистом Национальной оперы Украины имени Т. Г. Шевченко. Удостоен звания Заслуженный артист Украины.
Еще в студенческие годы Сергей одержал победу на международных и национальных вокальных конкурсах: «Голос Украины», имени Н. В. Лысенко, имени Б. Гмыри (I премия и золотая медаль) в Киеве, Всероссийском конкурсе оперных певцов «Санкт-Петербург», имени Г. Вишневской в Москве.
Сергей Ковнир много гастролирует – в Германии, Дании, Италии, Испании, Нидерландах, Португалии, России, Франции, Японии. В 2007 году он участвовал в постановке оперы «Евгений Онегин» на Зальцбургском фестивале (дирижер — Даниэль Баренбойм). На протяжении нескольких лет певец сотрудничает с Татарским академическим государственным театром оперы и балета имени Мусы Джалиля.
В репертуаре артиста – свыше двух десятков оперных партий, в том числе Гремин («Евгений Онегин» Чайковского), Сурин («Пиковая дама» Чайковского), Пимен («Борис Годунов» Мусоргского), Захария («Набукко» Верди), Рамфис («Аида» Верди), Камандор («Дон Жуан» Моцарта), Тимур («Турандот» Пуччини) и многие другие, а также вокальные партии в реквиемах Верди и Моцарта, в 9-й симфонии Бетховена и 14-й симфонии Шостаковича.