Сергей Макеев окончил Московскую государственную консерваторию имени П. И. Чайковского. Его преподавателем по классу инструментовки был Эдисон Денисов.
Работал в качестве аранжировщика и инструменталиста в группе «Голубые гитары». Создатель и художественный руководитель джаз-квинтета «Эдельвейс».
Принимал участие в спектаклях Московского академического Музыкального театра имени К. С. Станиславского и Вл. И. Немировича-Данченко (оперы «Так поступают все женщины» Моцарта, «Демон» Рубинштейна, «Вечер классической оперетты» и другие), участвовал в гастролях театра в США. Автор музыки для концерта к 100-летию театра.
Работает в Московском театре мюзикла со дня его основания (спектакли «Времена не выбирают», «Жизнь прекрасна!»). Участвовал в российских постановках мюзиклов «Зорро» и «Красавица и Чудовище» на сцене Московского Дворца молодежи.
Выступал на фестивале «Русские сезоны» в Канне, принимал участие в концертах Ирины Муравьевой в Канаде и США (как пианист-импровизатор). В рамках проекта «Ночь искусств» участвовал в озвучивании первого сохранившегося полнометражного мультфильма «Приключения принца Ахмеда» (Германия, 1926). Записал альбом японской музыки «Таношими» на кото и синтезаторе.
Музыкальный руководитель, дирижер и пианист джазовой программы Хиблы Герзмавы.
Автор детского мюзикла «Маленький принц», пьесы «По ком звонит колокол».
Преподавал эстрадное сольфеджио на факультете искусств Московского государственного университета и в Государственном институте театрального искусства (ГИТИС).
