Владимир Ткаченко в 2007 году окончил Санкт-Петербургскую государственную консерваторию имени Н. А. Римского-Корсакова (класс альта Алексея Людевига), затем продолжил обучение в аспирантуре вуза (класс Александра Рихтера). Стажировался в Университете Северной Айовы (США) под руководством Джулии Буллард (2009) и Струнной академии Нидерландов в классах Стефана Метца и Марка Данеля (2010). В 2014–2015 гг. обучался дирижированию у Марко Берретты в Академии музыки и театра ADADS в Пьяченце (Италия), в 2016-м – у профессора Берлинской консерватории Фреда Буткевица. Был стипендиатом Правительства Российской Федерации.
В 2009 году присоединился к национальному ансамблю «Солисты Киева» и вошел в состав струнного квартета Collegium. В 2011 году стал солистом оркестра Бурятского академического театра оперы и балета имени Г. Ц. Цыдынжапова (Улан-Удэ) с совмещением позиции ассистента главного дирижера театра. Спустя год был назначен дирижером театра. В 2013 году при поддержке Министерства культуры Республики Бурятия создал Молодежный камерный оркестр Республики Бурятия. В 2015–2019 гг. был дирижером Бурятской государственной филармонии.
С сезона 2019/20 – концертмейстер группы альтов и дирижер Пермского академического театра оперы и балета имени П. И. Чайковского. С ноября 2023-го – главный дирижер театра. Дирижер-постановщик проекта «Севагин / Самодуров / Пимонов» на музыку Вивальди, Раннева и Светличного (мировая премьера, 2022), монооперы Пуленка – Горлинского «Человеческий голос» (мировая премьера, 2023), балетов «Золушка» Прокофьева (возобновление, 2024) и «Орфей» Стравинского (2025), опер «Пиковая дама» Чайковского (2024) и «Самсон и Далила» Сен-Санса (2025).
В качестве дирижера ведет следующие спектакли театра: оперы «Дон Жуан» Моцарта, «Лючия ди Ламмермур» Доницетти, «Евгений Онегин» Чайковского, «Царская невеста» Римского-Корсакова, балеты «Щелкунчик» и «Лебединое озеро» Чайковского, «Баядерка» Минкуса, «Шут» и «Ромео и Джульетта» Прокофьева, «Шехеразада» на музыку Римского-Корсакова, «Конькобежцы» на музыку Мейербера, «Анюта» Гаврилина.
Сотрудничал с ансамблем «Солисты Москвы», ГСО «Новая Россия», оркестрами Приморской сцены Мариинского театра, Новосибирского театра оперы и балета, Санкт-Петербургской филармонии, Иркутской, Томской и Сочинской филармоний, Госоркестром Республики Беларусь, «Берлинской Камератой», камерными оркестрами Минской, Санкт-Петербургской, Монгольской филармоний, «Солистами Нижнего Новгорода» и другими коллективами.
Выступления Владимира Ткаченко записаны для радио- и телеархива. Музыкант также принимал участие в записи двух дисков с камерным и симфоническим оркестрами Санкт-Петербургской филармонии.
В 2023 году номинирован на российскую театральную премию «Золотая маска» за дирижерскую работу в балетах Ultima Thule и «Арктика» (Пермский театр оперы и балета).