Станислав Трофимов родился в Стерлитамаке. Окончил Оренбургский государственный институт искусств имени Л. и М. Ростроповичей. В 2006-2007 годах – солист Оренбургского муниципального камерного хора. Обладатель стипендии губернатора Оренбургской области.
В 2008-2014 годах – солист Челябинского государственного академического театра оперы и балета имени М. И. Глинки. В 2014—2016 годах – солист Екатеринбургского государственного академического театра оперы и балета.
В 2015 году певец дебютировал в Мариинском театре, с 2016 года – солист театра. Исполнял партии: Собакина и Князя Юрия («Царская невеста» и «Сказание о невидимом граде Китеже и деве Февронии» Римского-Корсакова), Пимена («Борис Годунов» Мусоргского), Даланда («Летучий голландец» Вагнера) и Филиппа II («Дон Карлос» Верди).
В 2013 году участвовал в гала-концерте «Молодые голоса Большого» на Исторической сцене Большого театра. В 2014 году исполнил в Большом театре партии Пимена («Борис Годунов») и Архиепископа («Орлеанская дева» Чайковского). В 2016 году – партии Священника («Катерина Измайлова» Шостаковича) и Лепорелло («Каменный гость» Даргомыжского).
В репертуаре певца также партии: Ивана Сусанина («Жизнь за царя» Глинки), Малюты Скуратова («Царская невеста» Римского-Корсакова), Хана Кончака, Галицкого и Скулы («Князь Игорь» Бородина), Фарлафа и Светозара («Руслан и Людмила» Глинки), Короля Рене и Гремина («Иоланта» и «Евгений Онегин» Чайковского), Старого цыгана («Алеко» Рахманинова), Мефистофеля («Фауст» Гуно), Короля Генриха («Лоэнгрин» Вагнера), Феррандо, Спарафучиле, Великого инквизитора и Фиеско («Трубадур», «Риголетто», «Дон Карлос» и «Симон Бокканегра» Верди), Командора и Бартоло («Дон Жуан» и «Свадьба Фигаро» Моцарта), Дулькамары («Любовный напиток» Доницетти), Анджелотти («Тоска» Пуччини), Старого иудея («Самсон и Далила» Сен-Санса), партии баса в Реквиеме Верди, «Маленькой торжественной мессе» Россини и «Патетической оратории» Свиридова.
Летом 2017 года Станислав Трофимов выступил на Зальцбургском фестивале в постановке «Леди Макбет Мценского уезда» под руководством Мариса Янсонса и на фестивале театра Арена ди Верона в опере «Набукко» (партия Захарии). Летом 2018 года певец примет участие в постановках опер «Пиковая дама» и «Искатели жемчуга» на Зальцбургском фестивале.
Станислав Трофимов является автором поэтических сборников, публикаций по искусствоведению и церковной культуре.